2 R语言入门运行样例
2.1 命令行界面
启动R软件后进入命令行界面,每输入一行命令,就在后面显示计算结果。 可以用向上和向下箭头访问历史命令; 可以从已经运行过的命令中用鼠标拖选加亮后, 用Ctrl+C复制后用Ctrl+V粘贴, 或用Ctrl+X一步完成复制粘贴, 粘贴的目标都是当前命令行。
如果使用RStudio软件, 有一个“Console窗格”相当于命令行界面。 在RStudio中, 可以用New File–Script file功能建立一个源程序文件(脚本文件), 在脚本文件中写程序, 然后用Run图标或者Ctrl+Enter键运行当前行或者选定的部分。
2.2 四则运算
四则运算如:
结果为1238.418, 前面显示的结果在行首加了井号,
这在R语言中表示注释。
本教程的输出前面一般都加了井号以区分于程序语句。
输出前面的方括号和序号1是在输出有多个值时提供的提示性序号,
只有单个值时为了统一起见也显示出来了。
这里1.23E3
是科学记数法,
表示\(1.23\times 10^3\)。
用星号*
表示乘法,用正斜杠/
表示除法。
用^
表示乘方运算,如
重要提示:关闭中文输入法,否则输入一些中文标点将导致程序错误。
2.2.1 计算例子
从52张扑克牌中任取3张, 有多少种不同的组合可能? 解答:有 \[ C_{52}^3 = \frac{52!}{3! (52-3)!} = \frac{52 \times 51 \times 50}{3\times 2 \times 1} \] 种, 在R中计算如:
2.2.2 练习
某人存入10000元1年期定期存款,年利率3%, 约定到期自动转存(包括利息)。问:
10年后本息共多少元?
需要存多少年这10000元才能增值到20000元?
成语说:“智者千虑,必有一失;愚者千虑,必有一得”。 设智者作判断的准确率为\(p_1 = 0.99\), 愚者作判断的准确率为\(p_2=0.01\), 计算智者做1000次独立的判断至少犯一次错误的概率, 与愚者做1000次独立判断至少对一次的概率。
2.3 数学函数
2.3.1 数学函数——平方根、指数、对数
例:
sqrt(6.25)
表示\(\sqrt{6.25}\),结果为2.5。
exp(1)
表示\(e^1\),结果为\(e=2.718282\)。
log10(10000)
表示\(\lg 10000\),结果为\(4\)。
log
为自然对数。
2.3.2 数学函数——取整
例:
round(1.1234, 2)
## [1] 1.12
round(-1.9876, 2)
## [1] -1.99
floor(1.1234)
## [1] 1
floor(-1.1234)
## [1] -2
ceiling(1.1234)
## [1] 2
ceiling(-1.1234)
## [1] -1
round(1.1234, 2)
表示把1.1234四舍五入到两位小数。
floor(1.1234)
表示把1.1234向下取整,结果为1。
ceiling(1.1234)
表示把1.1234向上取整,结果为2。
2.3.3 数学函数——三角函数
例:
pi
## [1] 3.141593
sin(pi/6)
## [1] 0.5
cos(pi/6)
## [1] 0.8660254
sqrt(3)/2
## [1] 0.8660254
tan(pi/6)
## [1] 0.5773503
pi
表示圆周率\(\pi\)。sin
正弦,
cos
余弦,
tan
正切,
自变量以弧度为单位。
pi/6
是\(30^\circ\)。
2.3.4 数学函数——反三角函数
例:
pi/6
## [1] 0.5235988
asin(0.5)
## [1] 0.5235988
acos(sqrt(3)/2)
## [1] 0.5235988
atan(sqrt(3)/3)
## [1] 0.5235988
asin
反正弦,
acos
反余弦,
atan
反正切,
结果以弧度为单位。
2.3.5 分布函数和分位数函数
例:
dnorm(x)
表示标准正态分布密度
\(\phi(x) = \frac{1}{\sqrt{2\pi}} e^{-\frac12 x^2}\).
pnorm(x)
表示标准正态分布函数\(\Phi(x) = \int_{-\infty}^x \phi(t) \,dt\)。
qnorm(y)
表示标准正态分布分位数函数
\(\Phi^{-1}(x)\)。
还有其它许多分布的密度函数、分布函数和分位数函数。
例如,
求自由度为10的t检验的双侧临界值。
其中qt(y,df)
表示自由度为df
的t分布的分位数函数。
2.4 输出
2.4.1 简单输出
命令行的计算结果直接显示在命令的后面。
在用source()
运行程序文件时,
需要用print()
函数显示一个表达式的结果,如:
用cat()
函数显示多项内容,
包括数值和文本,
文本包在两个单撇号或两个双撇号中,如:
cat()
函数最后一项一般是"\n"
, 表示换行。
忽略此项将不换行。
再次提示:要避免打开中文输入法导致误使用中文标点。
2.4.2 用sink()
函数作运行记录
R使用经常是在命令行逐行输入命令(程序),
结果紧接着显示在命令后面。
如何保存这些命令和显示结果?
在R命令行中运行过的命令会被保存在运行的工作文件夹中的一个名为.Rhistory的文件中。
用sink()
函数打开一个文本文件开始记录文本型输出结果。
结束记录时用空的sink()
即可关闭文件不再记录。
如
sink("tmpres01.txt", split=TRUE)
print(sin(pi/6))
print(cos(pi/6))
cat("t(10)的双侧0.05分位数(临界值)=", qt(1 - 0.05/2, 10), "\n")
sink()
sink()
用作输出记录主要是在测试运行中使用,
正常的输出应该使用cat()
函数、write.table()
、write.csv()
等函数。
2.4.3 练习
用
cat()
函数显示log10(2)=*** log10(5)=***
其中
***
应该代以实际函数值。用
sink()
函数开始把运行过程记录到文件“log001.txt”中,在命令行试验几个命令,然后关闭运行记录,查看生成的“log001.txt”的内容。
2.5 向量计算与变量赋值
R语言以向量为最小单位。用<-
赋值。如
一般的向量可以用c()
生成,
如
在程序语言中,变量用来保存输入的值或计算的结果。 变量可以存放各种不同类型的值, 如单个数值、多个数值(称为向量)、单个字符串、多个字符串(称为字符型向量),等等。 单个数值称为标量。
技术秘诀:用程序设计语言的术语描述, R语言是动态类型的, 其变量的类型不需要预先声明, 运行过程中允许变量类型改变, 实际上变量赋值是一种“绑定”(binding), 将一个变量的名称(变量名)与实际的一个存储位置联系在一起。 在命令行定义的变量称为全局变量。
用print()
函数显示向量或在命令行中显示向量时,
每行显示的行首会有方括号和数字序号,
代表该行显示的第一个向量元素的下标。如
12345678901:12345678920
## [1] 12345678901 12345678902 12345678903 12345678904 12345678905
## [6] 12345678906 12345678907 12345678908 12345678909 12345678910
## [11] 12345678911 12345678912 12345678913 12345678914 12345678915
## [16] 12345678916 12345678917 12345678918 12345678919 12345678920
向量可以和一个标量作四则运算, 结果是每个元素都和这个标量作四则运算,如:
x1 + 200
## [1] 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210
2*x1
## [1] 2 4 6 8 10 12 14 16 18 20
2520/x1
## [1] 2520 1260 840 630 504 420 360 315 280 252
两个等长的向量可以进行四则运算, 相当于对应元素进行四则运算,如
R的许多函数都可以用向量作为自变量, 结果是自变量的每个元素各自的函数值。 如
sqrt(x1)
## [1] 1.000000 1.414214 1.732051 2.000000 2.236068 2.449490 2.645751
## [8] 2.828427 3.000000 3.162278
结果是1到10的整数各自的平方根。
2.6 工作空间介绍
在命令行中定义的变量, 在退出R时,会提问是否保存工作空间, 初学时可选择保存, 真正用R进行数据分析时往往不保存工作空间。 再次启动R后, 能够看到以前定义的各个变量的值。
在使用R的官方版本时, 如果在Windows中使用, 一般把不同的数据分析项目放在不同的文件夹中。 将R的程序快捷图标复制到每一个项目的文件夹中, 并用右键菜单讲快捷图标的“属性”中“起始位置”改为空白。 要分析哪一个项目的数据, 就从那个项目文件夹中的R快捷图标启动, 这样可以保证不同的项目有不同的工作空间。
如果使用RStudio软件, 也需要把不同项目放在不同文件夹, 并且每个项目在RStudio中单独建立一个“项目”(project)。 要分析那个项目的数据, 就打开那个项目。 不同项目使用不同的工作空间。
RStudio中的“Environment”窗格会显示当前已定义的R变量与函数。
2.6.1 练习
- 某人存入10000元1年期定期存款,年利率3%, 约定到期自动转存(包括利息)。列出1、2、……、10年后的本息金额。
- 显示2的1,2,……, 20次方。
- 定义x1为1到10的向量,定义x2为x1的3倍,然后退出R,再次启动R,查看x1和x2的值。
2.7 绘图示例
2.7.1 函数曲线示例
如下程序用curve()
函数制作\(y=x^2\)函数的曲线图,
curve()
函数第二、第三自变量是绘图区间:
类似地,\(\sin(x)\)函数曲线图用如下程序可制作,
用abline()
函数添加参考线:
2.7.2 条形图示例
假设有10个男生,7个女生,如下程序绘制男生、女生人数的条形图:
利用适当选项可以人为定制颜色、控制条形宽窄。 实际问题中,个数(频数)一般是从数据中统计得到的。
2.7.5 练习
- 画\(\exp(x)\)在\((-2,2)\)区间的函数图形。
- 画\(\ln(x)\)在\((0.01, 10)\)区间的函数图形。
2.8 汇总统计示例
2.8.1 表格数据
统计用的输入数据典型样式是Excel表那样的表格数据。 表格数据特点:每一列应该是相同的类型(或者都是数值, 或者都是文字,或者都是日期), 每一列应该有一个名字。
这样的表格数据,一般可以保存为.csv格式: 数据项之间用逗号分开,文件本身是文本型的, 可以用普通记事本程序查看和编辑。 Excel表可以用“另存为”命令保存为.csv格式。 常用的数据库管理系统一般也可以把表保存为.csv格式。
2.8.2 读入表格数据
例如,taxsamp.csv
是这样一个csv格式表格数据文件,
可以用Excel打开,也可以用记事本程序或notepad++打开。
内容见本页面后面的附录。
用如下程序可以把.csv文件读入到R中:
程序中的选项header=TRUE
指明第一行作为变量名行,
选项as.is=TRUE
说明字符型列要原样读入而不是转换为因子(factor)。
读入的变量tax.tab
称为一个数据框(data.frame)。
head()
函数返回数据框或向量的前几项。
比较大的表最好不要显示整个表,
会使得前面的运行过程难以查看。
技巧:read.csv()
的一个改进版本是readr扩展包的read_csv()
函数,
此函数读入较大表格速度要快得多,
而且读入的转换设置更倾向于不做不必要的转换。
但是,
这两种输入方法的默认中文编码可能不一样。
2.8.3 练习
用Excel软件查看“taxsamp.csv”的内容(双击即可)。
用记事本程序或notepad++软件查看“taxsamp.csv”的内容。
读入“taxsamp.csv”到R数据框tax.tab中,查看tax.tab内容。
2.8.4 分类变量频数统计
在tax.tab中,
“征收方式”是一个分类变量。
用table()
函数计算每个不同值的个数,称为频数(frequency):
##
## 查帐征收 定期定额征收 定期定率征收
## 31 16 2
类似地可以统计 “申报渠道”的取值频数:
##
## 大厅申报 网上申报
## 18 31
也可以用table()
函数统计“征收方式”和“申报渠道”交叉分类频数,如:
##
## 大厅申报 网上申报
## 查帐征收 9 22
## 定期定额征收 9 7
## 定期定率征收 0 2
上述结果制表如下:
大厅申报 | 网上申报 | |
---|---|---|
查帐征收 | 9 | 22 |
定期定额征收 | 9 | 7 |
定期定率征收 | 0 | 2 |
2.8.5 数值型变量的统计
数值型变量可以计算各种不同的统计量, 如平均值、标准差和各个分位数。
summary()
可以给出最小值、最大值、中位数、四分之一分位数、四分之三分位数和平均值。如
## Min. 1st Qu. Median Mean 3rd Qu. Max.
## 0 650 2130 247327 9421 6048000
中位数是从小到大排序后排在中间的值。 四分之一和四分之三分位数类似。
统计函数以一个数值型向量为自变量,
包括sum
(求和), mean
(平均值), var
(样本方差), sd
(样本标准差),
min
(最小值), max
(最大值), range
(最小值和最大值)等。如
## [1] 247327.4
## [1] 1036453
如果数据中有缺失值,
可以删去缺失值后计算统计量,
这时在mean
, sd
等函数中加入na.rm=TRUE
选项。
2.9 运行源程序文件
用source()
函数可以运行保存在一个文本文件中的源程序。
比如,如下内容保存在文件ssq.r
中:
用如下source()
命令运行:
运行后就可以调用自定义函数sum.of.squares()
了。
2.9.1 源文件编码
源程序文件存在编码问题。
对于源程序编码与系统默认编码不同的情况,
在source()
函数中可以添加encoding=
选项。
例如,
保存为UTF-8编码的源程序在简体中文MS Windows系统的R中运行,
可以在source()
函数中可以添加encoding="UTF-8"
选项。
保存为GBK编码的源程序文件在MAC系统的R中运行,
可以在source()
函数中可以添加encoding="GBK"
选项。
在RStudio中, 可以打开一个源程序文件查看与编辑。 用快捷键“Ctrl+Enter”或快捷图标“Run”可以运行当前行或者加亮选中行, 快捷图标“Source”可以运行整个文件。 如果发现中文乱码, 可以用菜单“Reopen with encoding”选择合适的编码打开, 用菜单“Save with encoding”选择需要的编码保存。
2.9.2 当前工作目录
在用source()
调用源程序文件或者用read.csv()
读入数据文件时,
如果不写文件名的全路径,
就认为文件位置是在所谓“当前工作目录”。
用getwd()
函数可以查询当前工作目录,
用setwd()
函数可以设置当前工作目录。
在RStudio中用菜单“Session–Set working directory”设置当前工作目录。
在MS Windows操作系统中使用R软件时,
一种好的做法是把某个研究项目所有数据和程序放在某个文件夹如
c:\work
中,
把R的程序快捷图标复制到该目录中,
在资源管理器中对该图标调用鼠标右键菜单“属性”,
从弹出对话框中,把“起始位置”一栏清除。
这样,每次从这个快捷图标启动R,
就可以自动以所在子目录为当前工作目录,
工作空间和命令历史记录也默认存放在这里。
在MS Windows操作系统的R中使用文件路径时,
要用正斜杠作为连接符,
使用反斜杠则需要成对使用,
如setwd("d:/work")
或setwd("d:\\work")
。
如果使用RStudio软件, 将某个研究项目所有数据和程序放在某个文件夹中, 然后建立一个新项目(project)指向该文件夹。